物料的水分过低，加工对象的硬度偏高，加工时动力消耗大，增加了企业的生产成本，降低了秸秆颗粒机的使用寿命。水分过大则不易粉碎，增加了锤片的撞击次数，同时由于物料的摩擦和锤片的打击而产生热量，使加工对象内部水分蒸发，蒸发的水分与粉碎出的细粉形成糨糊而堵塞筛孔，减少了粉碎机的排料。一般将原料如谷物、玉米等的水分均控制在14%以下。

可在机器进料口设置永磁筒、或除铁器，以免影响压轮、模具和中心轴的使用寿命。由秸秆颗粒饲料在挤压过程中温度高达50-85℃，并且压轮在运转工作时承受较强的被动力，但又缺乏必要的、有效的粉尘保护装置，所以每隔2-5个工作日，必须清洗一次轴承，并加入耐高温油脂。秸秆颗粒机主轴每隔一个月清洗加油一次，齿轮箱间隔半年就要进行清洗保养，传动部分的螺丝紧固更换应随时进行。

在物料压制即将结束时，将少许麦皮拌合食用油并投入机器内，压制1-2分钟后停机，使模具孔内充满油料，以便下次开机就能投料生产，既保养模具，又节约工时。秸秆颗粒机停机后松动压轮调节螺丝，并清除残余料。

饲料机、秸秆颗粒机要按说明使用配套动力。过小，产量低、效果差;过大，浪费机电、加速机械磨损、缩短使用寿命。维护保养要在断电状态下进行。秸秆颗粒机、饲料机应放在适宜工作的地方。尽可能减少搬动次数。常检修、防水浸、防雨淋、防漏电、防火、防止使用霉变饲料。